神奇宝贝不可思议的生物。可是还没有人了解所有的神奇宝贝。以成为神奇宝贝大师为目标，继续着旅程的小智和伙伴皮卡丘在合众地区的冒险又开始了。新的相遇结识艾莉丝与神奇宝贝酒侍天桐的同时各种各样的邂逅，了解同伴的重要，在战斗中洋溢炽热的友情，不断成长。